Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTBP53611 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABGGTBP53611 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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