Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOSBP53539 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOSBP53539 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOSBP53539 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOSBP53539 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOSBP53539 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOSBP53539 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOSBP53539 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOSBP53539 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOSBP53539 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOSBP53539 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOSBP53539 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOSBP53539 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOSBP53539 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FOSBP53539 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOSBP53539 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOSBP53539 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOSBP53539 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOSBP53539 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOSBP53539 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOSBP53539 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOSBP53539 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOSBP53539 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOSBP53539 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOSBP53539 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOSBP53539 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FOSBP53539 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FOSBP53539 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOSBP53539 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOSBP53539 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOSBP53539 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOSBP53539 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOSBP53539 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOSBP53539 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOSBP53539 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOSBP53539 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOSBP53539 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOSBP53539 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOSBP53539 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOSBP53539 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOSBP53539 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOSBP53539 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOSBP53539 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOSBP53539 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOSBP53539 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOSBP53539 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOSBP53539 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FOSBP53539 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOSBP53539 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOSBP53539 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOSBP53539 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FOSBP53539 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOSBP53539 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOSBP53539 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOSBP53539 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOSBP53539 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOSBP53539 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOSBP53539 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOSBP53539 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOSBP53539 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOSBP53539 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOSBP53539 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOSBP53539 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOSBP53539 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOSBP53539 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOSBP53539 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOSBP53539 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOSBP53539 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOSBP53539 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOSBP53539 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOSBP53539 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOSBP53539 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOSBP53539 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOSBP53539 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOSBP53539 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FOSBP53539 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOSBP53539 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOSBP53539 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOSBP53539 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOSBP53539 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOSBP53539 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms