Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms