Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDT6P53370 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDT6P53370 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDT6P53370 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms