Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFIP1P53367 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP1P53367 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms