Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF138P52744 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms