Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLCN3P51790 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN3P51790 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms