Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR4P51571 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR4P51571 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR4P51571 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR4P51571 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSR4P51571 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR4P51571 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR4P51571 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR4P51571 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR4P51571 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR4P51571 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR4P51571 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR4P51571 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR4P51571 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR4P51571 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR4P51571 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR4P51571 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR4P51571 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR4P51571 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR4P51571 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR4P51571 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR4P51571 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR4P51571 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR4P51571 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR4P51571 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR4P51571 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR4P51571 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR4P51571 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR4P51571 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR4P51571 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR4P51571 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR4P51571 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR4P51571 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR4P51571 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR4P51571 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR4P51571 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR4P51571 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR4P51571 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR4P51571 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR4P51571 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR4P51571 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR4P51571 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR4P51571 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR4P51571 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR4P51571 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR4P51571 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR4P51571 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR4P51571 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR4P51571 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR4P51571 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR4P51571 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR4P51571 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR4P51571 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR4P51571 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR4P51571 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR4P51571 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR4P51571 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR4P51571 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR4P51571 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR4P51571 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR4P51571 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR4P51571 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR4P51571 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR4P51571 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR4P51571 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR4P51571 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR4P51571 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR4P51571 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR4P51571 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR4P51571 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR4P51571 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR4P51571 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR4P51571 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR4P51571 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR4P51571 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR4P51571 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR4P51571 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR4P51571 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR4P51571 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR4P51571 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR4P51571 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR4P51571 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR4P51571 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR4P51571 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR4P51571 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR4P51571 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR4P51571 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR4P51571 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR4P51571 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR4P51571 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR4P51571 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR4P51571 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR4P51571 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR4P51571 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR4P51571 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR4P51571 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR4P51571 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR4P51571 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR4P51571 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms