Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DAP3P51398 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DAP3P51398 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DAP3P51398 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DAP3P51398 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DAP3P51398 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DAP3P51398 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DAP3P51398 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DAP3P51398 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DAP3P51398 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DAP3P51398 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DAP3P51398 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DAP3P51398 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DAP3P51398 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DAP3P51398 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DAP3P51398 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DAP3P51398 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DAP3P51398 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DAP3P51398 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DAP3P51398 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DAP3P51398 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DAP3P51398 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DAP3P51398 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DAP3P51398 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DAP3P51398 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DAP3P51398 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DAP3P51398 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DAP3P51398 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DAP3P51398 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DAP3P51398 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DAP3P51398 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DAP3P51398 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DAP3P51398 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DAP3P51398 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DAP3P51398 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DAP3P51398 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DAP3P51398 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DAP3P51398 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DAP3P51398 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DAP3P51398 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DAP3P51398 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DAP3P51398 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DAP3P51398 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DAP3P51398 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DAP3P51398 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DAP3P51398 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DAP3P51398 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DAP3P51398 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DAP3P51398 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DAP3P51398 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DAP3P51398 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DAP3P51398 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DAP3P51398 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DAP3P51398 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DAP3P51398 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DAP3P51398 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DAP3P51398 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DAP3P51398 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DAP3P51398 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DAP3P51398 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DAP3P51398 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DAP3P51398 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DAP3P51398 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DAP3P51398 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DAP3P51398 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DAP3P51398 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DAP3P51398 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DAP3P51398 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DAP3P51398 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DAP3P51398 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DAP3P51398 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DAP3P51398 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DAP3P51398 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DAP3P51398 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DAP3P51398 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DAP3P51398 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DAP3P51398 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DAP3P51398 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DAP3P51398 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms