Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB27AP51159 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB27AP51159 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms