Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARRES1P49788 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RARRES1P49788 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RARRES1P49788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms