Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTCFP49711 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTCFP49711 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTCFP49711 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTCFP49711 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTCFP49711 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CTCFP49711 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTCFP49711 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTCFP49711 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CTCFP49711 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTCFP49711 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTCFP49711 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTCFP49711 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTCFP49711 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTCFP49711 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTCFP49711 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CTCFP49711 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTCFP49711 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTCFP49711 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTCFP49711 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTCFP49711 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTCFP49711 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTCFP49711 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTCFP49711 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTCFP49711 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTCFP49711 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTCFP49711 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTCFP49711 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTCFP49711 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTCFP49711 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTCFP49711 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTCFP49711 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTCFP49711 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTCFP49711 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTCFP49711 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTCFP49711 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTCFP49711 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTCFP49711 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTCFP49711 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CTCFP49711 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTCFP49711 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTCFP49711 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTCFP49711 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTCFP49711 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTCFP49711 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTCFP49711 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTCFP49711 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTCFP49711 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTCFP49711 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTCFP49711 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTCFP49711 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTCFP49711 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTCFP49711 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CTCFP49711 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CTCFP49711 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTCFP49711 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTCFP49711 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTCFP49711 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTCFP49711 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTCFP49711 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTCFP49711 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTCFP49711 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTCFP49711 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTCFP49711 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTCFP49711 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTCFP49711 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTCFP49711 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTCFP49711 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTCFP49711 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTCFP49711 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTCFP49711 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTCFP49711 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTCFP49711 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTCFP49711 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTCFP49711 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTCFP49711 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTCFP49711 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTCFP49711 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTCFP49711 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTCFP49711 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTCFP49711 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTCFP49711 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTCFP49711 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTCFP49711 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTCFP49711 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTCFP49711 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTCFP49711 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTCFP49711 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTCFP49711 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTCFP49711 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms