Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP4P49662 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP4P49662 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP4P49662 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP4P49662 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP4P49662 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASP4P49662 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP4P49662 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP4P49662 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP4P49662 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP4P49662 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP4P49662 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP4P49662 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP4P49662 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP4P49662 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP4P49662 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP4P49662 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP4P49662 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP4P49662 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP4P49662 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP4P49662 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP4P49662 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP4P49662 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP4P49662 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP4P49662 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP4P49662 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP4P49662 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP4P49662 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP4P49662 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP4P49662 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP4P49662 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP4P49662 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP4P49662 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP4P49662 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP4P49662 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP4P49662 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP4P49662 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP4P49662 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP4P49662 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP4P49662 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP4P49662 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP4P49662 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP4P49662 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP4P49662 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP4P49662 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP4P49662 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP4P49662 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP4P49662 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP4P49662 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP4P49662 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP4P49662 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP4P49662 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP4P49662 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP4P49662 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP4P49662 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP4P49662 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP4P49662 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CASP4P49662 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP4P49662 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP4P49662 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP4P49662 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP4P49662 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP4P49662 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP4P49662 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP4P49662 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP4P49662 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP4P49662 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP4P49662 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP4P49662 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP4P49662 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP4P49662 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP4P49662 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP4P49662 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP4P49662 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP4P49662 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP4P49662 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP4P49662 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP4P49662 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP4P49662 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP4P49662 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP4P49662 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP4P49662 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP4P49662 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP4P49662 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP4P49662 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP4P49662 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP4P49662 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP4P49662 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP4P49662 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP4P49662 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP4P49662 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP4P49662 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP4P49662 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP4P49662 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP4P49662 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP4P49662 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP4P49662 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP4P49662 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP4P49662 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP4P49662 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms