Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRP9P49458 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRP9P49458 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRP9P49458 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRP9P49458 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRP9P49458 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRP9P49458 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRP9P49458 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRP9P49458 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRP9P49458 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRP9P49458 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRP9P49458 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRP9P49458 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRP9P49458 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRP9P49458 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP9P49458 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP9P49458 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP9P49458 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP9P49458 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP9P49458 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP9P49458 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP9P49458 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP9P49458 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP9P49458 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP9P49458 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP9P49458 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP9P49458 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP9P49458 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP9P49458 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP9P49458 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP9P49458 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP9P49458 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP9P49458 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP9P49458 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP9P49458 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP9P49458 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP9P49458 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP9P49458 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP9P49458 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP9P49458 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP9P49458 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP9P49458 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP9P49458 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRP9P49458 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SRP9P49458 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP9P49458 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP9P49458 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP9P49458 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP9P49458 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP9P49458 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP9P49458 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP9P49458 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP9P49458 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP9P49458 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP9P49458 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP9P49458 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP9P49458 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP9P49458 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP9P49458 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP9P49458 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP9P49458 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP9P49458 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP9P49458 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP9P49458 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP9P49458 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP9P49458 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP9P49458 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP9P49458 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP9P49458 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP9P49458 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP9P49458 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP9P49458 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP9P49458 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP9P49458 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP9P49458 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP9P49458 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP9P49458 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP9P49458 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP9P49458 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP9P49458 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP9P49458 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP9P49458 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP9P49458 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP9P49458 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP9P49458 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP9P49458 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP9P49458 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP9P49458 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP9P49458 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP9P49458 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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