Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT3P49368 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT3P49368 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT3P49368 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT3P49368 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT3P49368 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT3P49368 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT3P49368 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT3P49368 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT3P49368 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT3P49368 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT3P49368 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT3P49368 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT3P49368 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT3P49368 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT3P49368 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT3P49368 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT3P49368 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT3P49368 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT3P49368 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT3P49368 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT3P49368 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT3P49368 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT3P49368 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT3P49368 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT3P49368 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT3P49368 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT3P49368 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT3P49368 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT3P49368 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT3P49368 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT3P49368 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT3P49368 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT3P49368 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT3P49368 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT3P49368 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT3P49368 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT3P49368 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT3P49368 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT3P49368 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT3P49368 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT3P49368 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT3P49368 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT3P49368 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT3P49368 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT3P49368 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT3P49368 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT3P49368 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCT3P49368 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCT3P49368 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCT3P49368 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT3P49368 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCT3P49368 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT3P49368 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT3P49368 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT3P49368 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT3P49368 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT3P49368 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT3P49368 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT3P49368 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT3P49368 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT3P49368 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT3P49368 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT3P49368 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT3P49368 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT3P49368 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT3P49368 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT3P49368 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT3P49368 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT3P49368 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT3P49368 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT3P49368 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT3P49368 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT3P49368 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT3P49368 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT3P49368 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT3P49368 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT3P49368 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT3P49368 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT3P49368 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT3P49368 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT3P49368 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT3P49368 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT3P49368 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT3P49368 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT3P49368 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT3P49368 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT3P49368 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT3P49368 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT3P49368 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms