Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
NESP48681 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
NESP48681 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
NESP48681 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
NESP48681 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
NESP48681 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
NESP48681 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
NESP48681 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
NESP48681 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
NESP48681 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
NESP48681 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
NESP48681 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
NESP48681 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
NESP48681 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
NESP48681 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
NESP48681 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC43.62■■■■■ 4.57
NESP48681 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
NESP48681 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
NESP48681 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
NESP48681 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
NESP48681 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
NESP48681 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
NESP48681 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
NESP48681 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC43.61■■■■■ 4.57
NESP48681 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
NESP48681 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
NESP48681 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
NESP48681 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
NESP48681 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
NESP48681 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
NESP48681 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
NESP48681 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
NESP48681 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
NESP48681 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
NESP48681 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
NESP48681 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
NESP48681 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
NESP48681 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
NESP48681 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
NESP48681 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
NESP48681 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
NESP48681 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
NESP48681 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
NESP48681 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
NESP48681 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
NESP48681 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
NESP48681 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
NESP48681 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
NESP48681 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
NESP48681 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
NESP48681 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC43.48■■■■■ 4.55
NESP48681 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
NESP48681 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
NESP48681 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
NESP48681 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
NESP48681 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
NESP48681 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
NESP48681 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
NESP48681 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
NESP48681 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NESP48681 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
NESP48681 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
NESP48681 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC43.44■■■■■ 4.55
NESP48681 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
NESP48681 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
NESP48681 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC43.44■■■■■ 4.54
NESP48681 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
NESP48681 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
NESP48681 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
NESP48681 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
NESP48681 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
NESP48681 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
NESP48681 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
NESP48681 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
NESP48681 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
NESP48681 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
NESP48681 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
NESP48681 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
NESP48681 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
NESP48681 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
NESP48681 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
NESP48681 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
NESP48681 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
NESP48681 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
NESP48681 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
NESP48681 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
NESP48681 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NESP48681 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NESP48681 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NESP48681 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NESP48681 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NESP48681 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
NESP48681 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
NESP48681 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NESP48681 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
NESP48681 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
NESP48681 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
NESP48681 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
NESP48681 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
NESP48681 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms