Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX9P48436 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX9P48436 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX9P48436 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX9P48436 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX9P48436 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX9P48436 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX9P48436 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX9P48436 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX9P48436 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX9P48436 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX9P48436 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX9P48436 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX9P48436 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX9P48436 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX9P48436 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX9P48436 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX9P48436 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX9P48436 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX9P48436 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX9P48436 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX9P48436 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX9P48436 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX9P48436 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX9P48436 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX9P48436 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX9P48436 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX9P48436 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX9P48436 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX9P48436 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX9P48436 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX9P48436 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX9P48436 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX9P48436 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX9P48436 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX9P48436 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX9P48436 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX9P48436 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX9P48436 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX9P48436 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX9P48436 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX9P48436 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX9P48436 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX9P48436 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX9P48436 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX9P48436 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX9P48436 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX9P48436 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX9P48436 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX9P48436 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX9P48436 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX9P48436 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX9P48436 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX9P48436 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX9P48436 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SOX9P48436 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX9P48436 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX9P48436 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX9P48436 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX9P48436 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX9P48436 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX9P48436 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX9P48436 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX9P48436 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX9P48436 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX9P48436 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX9P48436 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX9P48436 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX9P48436 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX9P48436 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX9P48436 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX9P48436 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX9P48436 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX9P48436 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX9P48436 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX9P48436 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX9P48436 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX9P48436 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX9P48436 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX9P48436 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX9P48436 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX9P48436 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX9P48436 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX9P48436 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX9P48436 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX9P48436 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX9P48436 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX9P48436 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX9P48436 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX9P48436 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX9P48436 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX9P48436 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX9P48436 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX9P48436 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX9P48436 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX9P48436 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX9P48436 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX9P48436 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX9P48436 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX9P48436 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms