Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP2P46087 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP2P46087 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP2P46087 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP2P46087 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP2P46087 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOP2P46087 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOP2P46087 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP2P46087 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP2P46087 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP2P46087 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP2P46087 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP2P46087 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP2P46087 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP2P46087 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP2P46087 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP2P46087 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms