Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP2P46087 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP2P46087 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP2P46087 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP2P46087 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP2P46087 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP2P46087 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOP2P46087 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOP2P46087 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP2P46087 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP2P46087 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP2P46087 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP2P46087 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP2P46087 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP2P46087 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP2P46087 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP2P46087 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP2P46087 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP2P46087 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP2P46087 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP2P46087 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP2P46087 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP2P46087 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP2P46087 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP2P46087 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP2P46087 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP2P46087 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP2P46087 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP2P46087 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms