Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SSR1P43307 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSR1P43307 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSR1P43307 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSR1P43307 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSR1P43307 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSR1P43307 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SSR1P43307 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSR1P43307 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSR1P43307 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSR1P43307 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSR1P43307 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSR1P43307 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSR1P43307 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSR1P43307 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSR1P43307 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSR1P43307 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSR1P43307 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSR1P43307 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSR1P43307 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSR1P43307 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSR1P43307 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSR1P43307 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSR1P43307 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSR1P43307 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSR1P43307 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSR1P43307 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSR1P43307 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSR1P43307 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSR1P43307 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SSR1P43307 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSR1P43307 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSR1P43307 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSR1P43307 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSR1P43307 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSR1P43307 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSR1P43307 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSR1P43307 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSR1P43307 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSR1P43307 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSR1P43307 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSR1P43307 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSR1P43307 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSR1P43307 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSR1P43307 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSR1P43307 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SSR1P43307 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SSR1P43307 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSR1P43307 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSR1P43307 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSR1P43307 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSR1P43307 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSR1P43307 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSR1P43307 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSR1P43307 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSR1P43307 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSR1P43307 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSR1P43307 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSR1P43307 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSR1P43307 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSR1P43307 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSR1P43307 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSR1P43307 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSR1P43307 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSR1P43307 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSR1P43307 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SSR1P43307 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSR1P43307 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSR1P43307 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSR1P43307 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSR1P43307 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSR1P43307 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSR1P43307 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSR1P43307 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSR1P43307 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSR1P43307 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSR1P43307 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSR1P43307 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSR1P43307 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SSR1P43307 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSR1P43307 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSR1P43307 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSR1P43307 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSR1P43307 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSR1P43307 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSR1P43307 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSR1P43307 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSR1P43307 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSR1P43307 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSR1P43307 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSR1P43307 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSR1P43307 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSR1P43307 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSR1P43307 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSR1P43307 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSR1P43307 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSR1P43307 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSR1P43307 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSR1P43307 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSR1P43307 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms