Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL35P42766 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL35P42766 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL35P42766 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL35P42766 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL35P42766 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL35P42766 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL35P42766 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL35P42766 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL35P42766 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL35P42766 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL35P42766 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL35P42766 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL35P42766 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL35P42766 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL35P42766 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL35P42766 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL35P42766 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL35P42766 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL35P42766 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL35P42766 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL35P42766 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL35P42766 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL35P42766 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL35P42766 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL35P42766 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL35P42766 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL35P42766 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL35P42766 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL35P42766 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL35P42766 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL35P42766 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL35P42766 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL35P42766 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL35P42766 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL35P42766 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL35P42766 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL35P42766 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL35P42766 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL35P42766 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL35P42766 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL35P42766 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL35P42766 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL35P42766 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL35P42766 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL35P42766 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL35P42766 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL35P42766 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL35P42766 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL35P42766 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL35P42766 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL35P42766 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL35P42766 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL35P42766 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL35P42766 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL35P42766 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPL35P42766 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPL35P42766 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL35P42766 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL35P42766 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL35P42766 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL35P42766 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL35P42766 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL35P42766 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL35P42766 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL35P42766 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL35P42766 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL35P42766 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL35P42766 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL35P42766 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL35P42766 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL35P42766 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL35P42766 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL35P42766 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL35P42766 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL35P42766 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL35P42766 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL35P42766 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL35P42766 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL35P42766 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL35P42766 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL35P42766 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL35P42766 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL35P42766 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL35P42766 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL35P42766 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL35P42766 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL35P42766 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL35P42766 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL35P42766 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL35P42766 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL35P42766 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL35P42766 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL35P42766 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL35P42766 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL35P42766 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL35P42766 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL35P42766 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL35P42766 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL35P42766 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms