Protein–RNA interactions for Protein: P41968

MC3R, Melanocortin receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC3RP41968 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC3RP41968 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC3RP41968 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC3RP41968 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MC3RP41968 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MC3RP41968 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MC3RP41968 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MC3RP41968 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC3RP41968 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC3RP41968 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC3RP41968 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC3RP41968 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC3RP41968 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC3RP41968 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MC3RP41968 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC3RP41968 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC3RP41968 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC3RP41968 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC3RP41968 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC3RP41968 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC3RP41968 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC3RP41968 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC3RP41968 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC3RP41968 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC3RP41968 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC3RP41968 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC3RP41968 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC3RP41968 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC3RP41968 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MC3RP41968 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC3RP41968 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC3RP41968 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC3RP41968 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC3RP41968 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC3RP41968 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC3RP41968 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC3RP41968 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MC3RP41968 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC3RP41968 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC3RP41968 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC3RP41968 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC3RP41968 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC3RP41968 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC3RP41968 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC3RP41968 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC3RP41968 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC3RP41968 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC3RP41968 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC3RP41968 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC3RP41968 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC3RP41968 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC3RP41968 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC3RP41968 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC3RP41968 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC3RP41968 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MC3RP41968 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MC3RP41968 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MC3RP41968 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MC3RP41968 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MC3RP41968 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MC3RP41968 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MC3RP41968 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MC3RP41968 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MC3RP41968 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MC3RP41968 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MC3RP41968 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MC3RP41968 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MC3RP41968 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MC3RP41968 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MC3RP41968 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC3RP41968 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC3RP41968 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MC3RP41968 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC3RP41968 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC3RP41968 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC3RP41968 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC3RP41968 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC3RP41968 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC3RP41968 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC3RP41968 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC3RP41968 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MC3RP41968 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MC3RP41968 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MC3RP41968 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MC3RP41968 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MC3RP41968 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MC3RP41968 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms