Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR3P41439 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOLR3P41439 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms