Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBX2P40425 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBX2P40425 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBX2P40425 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBX2P40425 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBX2P40425 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBX2P40425 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBX2P40425 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBX2P40425 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX2P40425 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX2P40425 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX2P40425 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX2P40425 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX2P40425 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBX2P40425 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBX2P40425 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PBX2P40425 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBX2P40425 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBX2P40425 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBX2P40425 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBX2P40425 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX2P40425 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX2P40425 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX2P40425 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX2P40425 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX2P40425 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX2P40425 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX2P40425 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX2P40425 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX2P40425 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX2P40425 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX2P40425 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX2P40425 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX2P40425 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX2P40425 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX2P40425 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX2P40425 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX2P40425 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX2P40425 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX2P40425 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX2P40425 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX2P40425 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX2P40425 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX2P40425 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX2P40425 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PBX2P40425 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX2P40425 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX2P40425 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX2P40425 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX2P40425 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX2P40425 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX2P40425 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX2P40425 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX2P40425 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX2P40425 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX2P40425 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX2P40425 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX2P40425 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX2P40425 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX2P40425 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX2P40425 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX2P40425 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX2P40425 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX2P40425 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX2P40425 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX2P40425 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX2P40425 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX2P40425 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX2P40425 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX2P40425 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX2P40425 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX2P40425 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX2P40425 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX2P40425 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX2P40425 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX2P40425 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX2P40425 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX2P40425 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX2P40425 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX2P40425 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX2P40425 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX2P40425 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX2P40425 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX2P40425 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX2P40425 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX2P40425 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX2P40425 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX2P40425 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX2P40425 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX2P40425 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX2P40425 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX2P40425 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX2P40425 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX2P40425 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX2P40425 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX2P40425 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX2P40425 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX2P40425 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX2P40425 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PBX2P40425 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms