Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX1P40424 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX1P40424 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX1P40424 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX1P40424 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX1P40424 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX1P40424 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX1P40424 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX1P40424 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX1P40424 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX1P40424 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX1P40424 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX1P40424 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX1P40424 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX1P40424 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX1P40424 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX1P40424 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX1P40424 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX1P40424 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX1P40424 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PBX1P40424 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBX1P40424 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBX1P40424 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBX1P40424 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX1P40424 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX1P40424 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX1P40424 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX1P40424 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX1P40424 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX1P40424 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX1P40424 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX1P40424 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX1P40424 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX1P40424 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX1P40424 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX1P40424 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX1P40424 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX1P40424 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX1P40424 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX1P40424 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX1P40424 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX1P40424 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PBX1P40424 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX1P40424 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX1P40424 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX1P40424 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX1P40424 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX1P40424 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX1P40424 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX1P40424 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX1P40424 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX1P40424 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX1P40424 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX1P40424 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX1P40424 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX1P40424 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX1P40424 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX1P40424 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX1P40424 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX1P40424 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX1P40424 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX1P40424 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX1P40424 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX1P40424 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX1P40424 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX1P40424 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX1P40424 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX1P40424 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX1P40424 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX1P40424 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX1P40424 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX1P40424 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX1P40424 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX1P40424 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX1P40424 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX1P40424 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX1P40424 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX1P40424 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX1P40424 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX1P40424 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX1P40424 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PBX1P40424 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PBX1P40424 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PBX1P40424 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PBX1P40424 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PBX1P40424 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PBX1P40424 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PBX1P40424 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PBX1P40424 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX1P40424 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX1P40424 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms