Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL4P36578 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL4P36578 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL4P36578 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL4P36578 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL4P36578 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL4P36578 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL4P36578 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL4P36578 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL4P36578 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL4P36578 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL4P36578 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL4P36578 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL4P36578 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL4P36578 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL4P36578 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL4P36578 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL4P36578 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL4P36578 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL4P36578 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL4P36578 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL4P36578 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL4P36578 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL4P36578 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL4P36578 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL4P36578 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL4P36578 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL4P36578 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL4P36578 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL4P36578 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL4P36578 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL4P36578 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL4P36578 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL4P36578 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL4P36578 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL4P36578 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL4P36578 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL4P36578 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL4P36578 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL4P36578 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL4P36578 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL4P36578 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL4P36578 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL4P36578 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL4P36578 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL4P36578 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL4P36578 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL4P36578 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL4P36578 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL4P36578 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL4P36578 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL4P36578 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms