Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HNF1BP35680 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HNF1BP35680 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms