Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORAP35398 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORAP35398 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RORAP35398 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORAP35398 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORAP35398 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RORAP35398 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RORAP35398 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RORAP35398 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RORAP35398 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RORAP35398 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORAP35398 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORAP35398 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORAP35398 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORAP35398 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORAP35398 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORAP35398 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORAP35398 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORAP35398 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORAP35398 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORAP35398 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORAP35398 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RORAP35398 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORAP35398 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RORAP35398 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORAP35398 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORAP35398 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORAP35398 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORAP35398 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORAP35398 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORAP35398 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORAP35398 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORAP35398 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORAP35398 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORAP35398 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORAP35398 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORAP35398 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORAP35398 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RORAP35398 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RORAP35398 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RORAP35398 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RORAP35398 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RORAP35398 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RORAP35398 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RORAP35398 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORAP35398 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORAP35398 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORAP35398 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORAP35398 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORAP35398 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORAP35398 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORAP35398 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORAP35398 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORAP35398 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORAP35398 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RORAP35398 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORAP35398 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORAP35398 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORAP35398 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RORAP35398 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RORAP35398 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RORAP35398 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RORAP35398 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RORAP35398 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RORAP35398 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORAP35398 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORAP35398 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORAP35398 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORAP35398 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORAP35398 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORAP35398 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORAP35398 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORAP35398 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORAP35398 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORAP35398 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORAP35398 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RORAP35398 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORAP35398 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORAP35398 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORAP35398 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORAP35398 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORAP35398 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORAP35398 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORAP35398 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORAP35398 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORAP35398 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORAP35398 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORAP35398 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORAP35398 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORAP35398 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORAP35398 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORAP35398 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORAP35398 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORAP35398 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORAP35398 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORAP35398 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORAP35398 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORAP35398 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORAP35398 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORAP35398 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms