Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA5AP35218 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CA5AP35218 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA5AP35218 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA5AP35218 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA5AP35218 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA5AP35218 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA5AP35218 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA5AP35218 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA5AP35218 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CA5AP35218 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA5AP35218 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA5AP35218 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CA5AP35218 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA5AP35218 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA5AP35218 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA5AP35218 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA5AP35218 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA5AP35218 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA5AP35218 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA5AP35218 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA5AP35218 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA5AP35218 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA5AP35218 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA5AP35218 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA5AP35218 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA5AP35218 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA5AP35218 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA5AP35218 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CA5AP35218 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA5AP35218 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA5AP35218 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA5AP35218 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA5AP35218 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA5AP35218 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA5AP35218 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA5AP35218 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA5AP35218 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA5AP35218 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA5AP35218 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA5AP35218 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA5AP35218 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA5AP35218 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA5AP35218 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CA5AP35218 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA5AP35218 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA5AP35218 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA5AP35218 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA5AP35218 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA5AP35218 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA5AP35218 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA5AP35218 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CA5AP35218 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA5AP35218 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA5AP35218 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA5AP35218 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA5AP35218 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA5AP35218 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA5AP35218 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA5AP35218 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CA5AP35218 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CA5AP35218 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA5AP35218 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA5AP35218 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA5AP35218 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA5AP35218 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA5AP35218 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA5AP35218 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA5AP35218 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA5AP35218 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA5AP35218 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA5AP35218 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA5AP35218 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA5AP35218 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA5AP35218 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA5AP35218 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA5AP35218 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA5AP35218 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CA5AP35218 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA5AP35218 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA5AP35218 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA5AP35218 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA5AP35218 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA5AP35218 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA5AP35218 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA5AP35218 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA5AP35218 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CA5AP35218 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA5AP35218 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA5AP35218 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA5AP35218 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms