Protein–RNA interactions for Protein: P34059

GALNS, N-acetylgalactosamine-6-sulfatase, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNSP34059 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNSP34059 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNSP34059 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNSP34059 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNSP34059 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GALNSP34059 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNSP34059 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNSP34059 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNSP34059 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNSP34059 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GALNSP34059 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GALNSP34059 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GALNSP34059 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GALNSP34059 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GALNSP34059 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GALNSP34059 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GALNSP34059 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GALNSP34059 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GALNSP34059 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GALNSP34059 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALNSP34059 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALNSP34059 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GALNSP34059 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALNSP34059 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALNSP34059 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALNSP34059 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALNSP34059 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALNSP34059 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALNSP34059 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALNSP34059 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALNSP34059 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALNSP34059 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALNSP34059 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALNSP34059 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALNSP34059 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALNSP34059 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALNSP34059 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALNSP34059 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALNSP34059 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALNSP34059 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALNSP34059 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALNSP34059 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALNSP34059 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALNSP34059 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GALNSP34059 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GALNSP34059 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GALNSP34059 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GALNSP34059 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALNSP34059 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GALNSP34059 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GALNSP34059 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALNSP34059 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALNSP34059 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALNSP34059 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALNSP34059 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALNSP34059 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALNSP34059 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALNSP34059 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALNSP34059 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALNSP34059 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALNSP34059 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALNSP34059 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALNSP34059 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALNSP34059 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALNSP34059 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALNSP34059 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALNSP34059 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALNSP34059 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALNSP34059 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALNSP34059 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALNSP34059 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALNSP34059 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALNSP34059 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GALNSP34059 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALNSP34059 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALNSP34059 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALNSP34059 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALNSP34059 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALNSP34059 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALNSP34059 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALNSP34059 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALNSP34059 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALNSP34059 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALNSP34059 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALNSP34059 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GALNSP34059 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALNSP34059 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALNSP34059 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALNSP34059 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALNSP34059 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALNSP34059 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALNSP34059 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALNSP34059 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALNSP34059 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALNSP34059 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALNSP34059 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALNSP34059 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALNSP34059 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALNSP34059 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALNSP34059 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms