Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA11P31270 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA11P31270 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA11P31270 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms