Protein–RNA interactions for Protein: P29992

GNA11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNA11P29992 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNA11P29992 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNA11P29992 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GNA11P29992 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNA11P29992 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GNA11P29992 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNA11P29992 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GNA11P29992 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNA11P29992 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNA11P29992 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNA11P29992 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNA11P29992 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNA11P29992 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNA11P29992 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNA11P29992 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNA11P29992 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNA11P29992 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNA11P29992 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNA11P29992 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNA11P29992 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNA11P29992 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNA11P29992 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNA11P29992 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GNA11P29992 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNA11P29992 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNA11P29992 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNA11P29992 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNA11P29992 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNA11P29992 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNA11P29992 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNA11P29992 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNA11P29992 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNA11P29992 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNA11P29992 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GNA11P29992 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNA11P29992 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNA11P29992 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNA11P29992 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNA11P29992 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNA11P29992 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNA11P29992 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNA11P29992 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNA11P29992 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNA11P29992 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNA11P29992 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNA11P29992 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNA11P29992 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNA11P29992 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GNA11P29992 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNA11P29992 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNA11P29992 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNA11P29992 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNA11P29992 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNA11P29992 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNA11P29992 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNA11P29992 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNA11P29992 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNA11P29992 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GNA11P29992 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNA11P29992 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNA11P29992 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNA11P29992 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNA11P29992 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNA11P29992 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNA11P29992 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNA11P29992 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNA11P29992 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNA11P29992 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNA11P29992 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNA11P29992 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNA11P29992 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNA11P29992 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNA11P29992 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNA11P29992 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNA11P29992 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNA11P29992 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNA11P29992 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNA11P29992 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNA11P29992 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNA11P29992 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNA11P29992 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNA11P29992 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNA11P29992 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNA11P29992 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNA11P29992 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNA11P29992 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GNA11P29992 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNA11P29992 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNA11P29992 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNA11P29992 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNA11P29992 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNA11P29992 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNA11P29992 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNA11P29992 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNA11P29992 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GNA11P29992 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GNA11P29992 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GNA11P29992 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GNA11P29992 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GNA11P29992 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms