Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCSK6P29122 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK6P29122 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK6P29122 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms