Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAP3P28838 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAP3P28838 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAP3P28838 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAP3P28838 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAP3P28838 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAP3P28838 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAP3P28838 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAP3P28838 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAP3P28838 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAP3P28838 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAP3P28838 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAP3P28838 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAP3P28838 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAP3P28838 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAP3P28838 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAP3P28838 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAP3P28838 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAP3P28838 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAP3P28838 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAP3P28838 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LAP3P28838 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAP3P28838 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAP3P28838 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAP3P28838 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAP3P28838 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAP3P28838 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAP3P28838 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LAP3P28838 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAP3P28838 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAP3P28838 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LAP3P28838 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAP3P28838 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAP3P28838 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAP3P28838 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAP3P28838 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAP3P28838 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAP3P28838 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAP3P28838 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAP3P28838 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAP3P28838 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LAP3P28838 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAP3P28838 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAP3P28838 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAP3P28838 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAP3P28838 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAP3P28838 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAP3P28838 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAP3P28838 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAP3P28838 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAP3P28838 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAP3P28838 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAP3P28838 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAP3P28838 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LAP3P28838 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAP3P28838 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAP3P28838 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAP3P28838 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAP3P28838 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAP3P28838 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAP3P28838 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAP3P28838 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAP3P28838 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAP3P28838 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAP3P28838 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAP3P28838 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAP3P28838 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAP3P28838 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAP3P28838 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAP3P28838 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAP3P28838 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAP3P28838 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAP3P28838 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAP3P28838 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAP3P28838 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAP3P28838 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAP3P28838 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAP3P28838 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms