Protein–RNA interactions for Protein: P27540

ARNT, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTP27540 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARNTP27540 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARNTP27540 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARNTP27540 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARNTP27540 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARNTP27540 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARNTP27540 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARNTP27540 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARNTP27540 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARNTP27540 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARNTP27540 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARNTP27540 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARNTP27540 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARNTP27540 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARNTP27540 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARNTP27540 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARNTP27540 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARNTP27540 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARNTP27540 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARNTP27540 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARNTP27540 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARNTP27540 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARNTP27540 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARNTP27540 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARNTP27540 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARNTP27540 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARNTP27540 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARNTP27540 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARNTP27540 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARNTP27540 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARNTP27540 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARNTP27540 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARNTP27540 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARNTP27540 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARNTP27540 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARNTP27540 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARNTP27540 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARNTP27540 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARNTP27540 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARNTP27540 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARNTP27540 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARNTP27540 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARNTP27540 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARNTP27540 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARNTP27540 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARNTP27540 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARNTP27540 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARNTP27540 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARNTP27540 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARNTP27540 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARNTP27540 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARNTP27540 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARNTP27540 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARNTP27540 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARNTP27540 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARNTP27540 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARNTP27540 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARNTP27540 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARNTP27540 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARNTP27540 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARNTP27540 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARNTP27540 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARNTP27540 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARNTP27540 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARNTP27540 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARNTP27540 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARNTP27540 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARNTP27540 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARNTP27540 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARNTP27540 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARNTP27540 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARNTP27540 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARNTP27540 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARNTP27540 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARNTP27540 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARNTP27540 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARNTP27540 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARNTP27540 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARNTP27540 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARNTP27540 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARNTP27540 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARNTP27540 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARNTP27540 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARNTP27540 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARNTP27540 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARNTP27540 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARNTP27540 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARNTP27540 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms