Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4BP23588 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF4BP23588 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF4BP23588 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms