Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFKB1P19838 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKB1P19838 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms