Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATF3P18847 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF3P18847 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF3P18847 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF3P18847 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF3P18847 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF3P18847 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF3P18847 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF3P18847 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATF3P18847 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATF3P18847 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATF3P18847 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATF3P18847 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATF3P18847 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ATF3P18847 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ATF3P18847 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ATF3P18847 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATF3P18847 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATF3P18847 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATF3P18847 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATF3P18847 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATF3P18847 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATF3P18847 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATF3P18847 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATF3P18847 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
ATF3P18847 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATF3P18847 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATF3P18847 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATF3P18847 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATF3P18847 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATF3P18847 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATF3P18847 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATF3P18847 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATF3P18847 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATF3P18847 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATF3P18847 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
ATF3P18847 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATF3P18847 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATF3P18847 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATF3P18847 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATF3P18847 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATF3P18847 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATF3P18847 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATF3P18847 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ATF3P18847 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATF3P18847 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATF3P18847 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATF3P18847 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATF3P18847 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATF3P18847 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATF3P18847 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATF3P18847 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATF3P18847 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATF3P18847 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATF3P18847 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ATF3P18847 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ATF3P18847 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATF3P18847 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATF3P18847 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ATF3P18847 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATF3P18847 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATF3P18847 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATF3P18847 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATF3P18847 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATF3P18847 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATF3P18847 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATF3P18847 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATF3P18847 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATF3P18847 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATF3P18847 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATF3P18847 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATF3P18847 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATF3P18847 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATF3P18847 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATF3P18847 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATF3P18847 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATF3P18847 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATF3P18847 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATF3P18847 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATF3P18847 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF3P18847 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF3P18847 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF3P18847 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF3P18847 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF3P18847 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF3P18847 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF3P18847 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ATF3P18847 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATF3P18847 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATF3P18847 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ATF3P18847 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATF3P18847 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATF3P18847 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATF3P18847 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ATF3P18847 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ATF3P18847 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATF3P18847 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATF3P18847 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATF3P18847 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATF3P18847 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms