Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN1P18031 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN1P18031 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms