Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYN1P17600 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYN1P17600 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYN1P17600 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYN1P17600 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYN1P17600 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYN1P17600 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYN1P17600 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYN1P17600 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYN1P17600 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYN1P17600 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYN1P17600 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYN1P17600 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYN1P17600 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYN1P17600 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYN1P17600 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYN1P17600 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYN1P17600 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYN1P17600 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYN1P17600 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYN1P17600 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYN1P17600 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYN1P17600 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYN1P17600 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYN1P17600 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYN1P17600 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYN1P17600 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYN1P17600 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYN1P17600 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYN1P17600 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYN1P17600 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYN1P17600 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYN1P17600 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYN1P17600 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYN1P17600 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYN1P17600 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SYN1P17600 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYN1P17600 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYN1P17600 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYN1P17600 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYN1P17600 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYN1P17600 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYN1P17600 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYN1P17600 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYN1P17600 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYN1P17600 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYN1P17600 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYN1P17600 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYN1P17600 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYN1P17600 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYN1P17600 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYN1P17600 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYN1P17600 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYN1P17600 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYN1P17600 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYN1P17600 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYN1P17600 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYN1P17600 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYN1P17600 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYN1P17600 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYN1P17600 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYN1P17600 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYN1P17600 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYN1P17600 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYN1P17600 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYN1P17600 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYN1P17600 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYN1P17600 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYN1P17600 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYN1P17600 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYN1P17600 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYN1P17600 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYN1P17600 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYN1P17600 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYN1P17600 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYN1P17600 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYN1P17600 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYN1P17600 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYN1P17600 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYN1P17600 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYN1P17600 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYN1P17600 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYN1P17600 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYN1P17600 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYN1P17600 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYN1P17600 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYN1P17600 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYN1P17600 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYN1P17600 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYN1P17600 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYN1P17600 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYN1P17600 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYN1P17600 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYN1P17600 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYN1P17600 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SYN1P17600 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYN1P17600 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYN1P17600 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYN1P17600 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYN1P17600 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms