Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKMT2P17540 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKMT2P17540 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms