Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3L1P16619 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCL3L1P16619 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms