Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPB42P16452 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EPB42P16452 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPB42P16452 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPB42P16452 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPB42P16452 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPB42P16452 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPB42P16452 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPB42P16452 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EPB42P16452 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPB42P16452 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPB42P16452 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
EPB42P16452 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPB42P16452 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPB42P16452 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPB42P16452 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPB42P16452 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EPB42P16452 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPB42P16452 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPB42P16452 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPB42P16452 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPB42P16452 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPB42P16452 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPB42P16452 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPB42P16452 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPB42P16452 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPB42P16452 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPB42P16452 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPB42P16452 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPB42P16452 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPB42P16452 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPB42P16452 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPB42P16452 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EPB42P16452 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPB42P16452 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPB42P16452 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPB42P16452 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPB42P16452 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPB42P16452 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPB42P16452 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPB42P16452 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPB42P16452 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPB42P16452 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPB42P16452 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPB42P16452 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPB42P16452 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPB42P16452 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPB42P16452 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPB42P16452 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPB42P16452 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPB42P16452 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPB42P16452 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPB42P16452 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EPB42P16452 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPB42P16452 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPB42P16452 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPB42P16452 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPB42P16452 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPB42P16452 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPB42P16452 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPB42P16452 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPB42P16452 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPB42P16452 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPB42P16452 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPB42P16452 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPB42P16452 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPB42P16452 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPB42P16452 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPB42P16452 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPB42P16452 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPB42P16452 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPB42P16452 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPB42P16452 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPB42P16452 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPB42P16452 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPB42P16452 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPB42P16452 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPB42P16452 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPB42P16452 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPB42P16452 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPB42P16452 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPB42P16452 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPB42P16452 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPB42P16452 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPB42P16452 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPB42P16452 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPB42P16452 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPB42P16452 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPB42P16452 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EPB42P16452 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPB42P16452 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPB42P16452 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPB42P16452 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPB42P16452 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPB42P16452 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPB42P16452 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPB42P16452 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPB42P16452 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPB42P16452 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPB42P16452 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms