Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSPP15924 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSPP15924 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSPP15924 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSPP15924 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSPP15924 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSPP15924 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSPP15924 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DSPP15924 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSPP15924 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSPP15924 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSPP15924 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSPP15924 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSPP15924 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSPP15924 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSPP15924 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSPP15924 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSPP15924 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
DSPP15924 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSPP15924 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSPP15924 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSPP15924 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DSPP15924 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DSPP15924 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSPP15924 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSPP15924 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSPP15924 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSPP15924 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSPP15924 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSPP15924 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSPP15924 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSPP15924 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSPP15924 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSPP15924 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSPP15924 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSPP15924 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSPP15924 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSPP15924 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSPP15924 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSPP15924 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSPP15924 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSPP15924 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSPP15924 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DSPP15924 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSPP15924 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSPP15924 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSPP15924 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSPP15924 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DSPP15924 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSPP15924 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSPP15924 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSPP15924 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSPP15924 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DSPP15924 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSPP15924 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSPP15924 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSPP15924 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSPP15924 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSPP15924 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSPP15924 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSPP15924 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSPP15924 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSPP15924 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSPP15924 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSPP15924 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSPP15924 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSPP15924 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSPP15924 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSPP15924 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSPP15924 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSPP15924 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSPP15924 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSPP15924 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DSPP15924 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSPP15924 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSPP15924 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSPP15924 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSPP15924 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DSPP15924 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSPP15924 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms