Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRAFP15056 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRAFP15056 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRAFP15056 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRAFP15056 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRAFP15056 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRAFP15056 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRAFP15056 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRAFP15056 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRAFP15056 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRAFP15056 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRAFP15056 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRAFP15056 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRAFP15056 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRAFP15056 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRAFP15056 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRAFP15056 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRAFP15056 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRAFP15056 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRAFP15056 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRAFP15056 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BRAFP15056 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRAFP15056 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRAFP15056 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRAFP15056 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRAFP15056 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRAFP15056 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRAFP15056 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BRAFP15056 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRAFP15056 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRAFP15056 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRAFP15056 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRAFP15056 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRAFP15056 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRAFP15056 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRAFP15056 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRAFP15056 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRAFP15056 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRAFP15056 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRAFP15056 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRAFP15056 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRAFP15056 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRAFP15056 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRAFP15056 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRAFP15056 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRAFP15056 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRAFP15056 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRAFP15056 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRAFP15056 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAFP15056 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAFP15056 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAFP15056 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAFP15056 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAFP15056 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAFP15056 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAFP15056 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAFP15056 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAFP15056 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAFP15056 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAFP15056 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAFP15056 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRAFP15056 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAFP15056 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAFP15056 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAFP15056 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAFP15056 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAFP15056 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAFP15056 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAFP15056 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAFP15056 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAFP15056 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAFP15056 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAFP15056 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAFP15056 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAFP15056 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAFP15056 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAFP15056 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAFP15056 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRAFP15056 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAFP15056 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRAFP15056 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRAFP15056 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRAFP15056 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRAFP15056 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRAFP15056 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRAFP15056 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRAFP15056 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAFP15056 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAFP15056 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAFP15056 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAFP15056 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms