Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NID1P14543 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NID1P14543 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NID1P14543 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NID1P14543 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NID1P14543 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NID1P14543 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NID1P14543 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NID1P14543 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NID1P14543 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NID1P14543 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NID1P14543 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NID1P14543 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NID1P14543 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NID1P14543 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NID1P14543 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NID1P14543 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NID1P14543 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NID1P14543 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NID1P14543 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NID1P14543 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NID1P14543 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NID1P14543 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NID1P14543 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NID1P14543 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NID1P14543 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NID1P14543 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NID1P14543 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NID1P14543 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NID1P14543 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NID1P14543 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NID1P14543 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NID1P14543 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NID1P14543 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NID1P14543 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NID1P14543 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NID1P14543 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NID1P14543 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NID1P14543 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NID1P14543 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NID1P14543 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NID1P14543 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NID1P14543 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NID1P14543 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NID1P14543 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NID1P14543 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NID1P14543 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NID1P14543 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NID1P14543 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NID1P14543 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NID1P14543 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NID1P14543 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NID1P14543 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NID1P14543 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NID1P14543 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NID1P14543 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NID1P14543 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NID1P14543 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NID1P14543 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NID1P14543 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NID1P14543 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NID1P14543 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NID1P14543 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NID1P14543 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NID1P14543 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NID1P14543 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NID1P14543 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NID1P14543 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NID1P14543 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NID1P14543 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NID1P14543 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NID1P14543 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NID1P14543 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NID1P14543 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NID1P14543 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NID1P14543 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NID1P14543 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NID1P14543 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NID1P14543 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NID1P14543 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NID1P14543 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NID1P14543 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NID1P14543 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NID1P14543 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NID1P14543 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms