Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIP12755 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIP12755 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIP12755 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKIP12755 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKIP12755 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKIP12755 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIP12755 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIP12755 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIP12755 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIP12755 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIP12755 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIP12755 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIP12755 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIP12755 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIP12755 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIP12755 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIP12755 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIP12755 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIP12755 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIP12755 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIP12755 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIP12755 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIP12755 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIP12755 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIP12755 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIP12755 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIP12755 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIP12755 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIP12755 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIP12755 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIP12755 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIP12755 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIP12755 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIP12755 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIP12755 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIP12755 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIP12755 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIP12755 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIP12755 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIP12755 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIP12755 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIP12755 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIP12755 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIP12755 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIP12755 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIP12755 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKIP12755 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKIP12755 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKIP12755 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKIP12755 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKIP12755 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKIP12755 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKIP12755 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKIP12755 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKIP12755 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKIP12755 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SKIP12755 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIP12755 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIP12755 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIP12755 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIP12755 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIP12755 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIP12755 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIP12755 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIP12755 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIP12755 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIP12755 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIP12755 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKIP12755 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIP12755 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIP12755 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIP12755 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIP12755 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIP12755 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIP12755 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIP12755 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIP12755 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIP12755 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIP12755 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIP12755 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIP12755 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIP12755 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIP12755 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIP12755 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIP12755 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIP12755 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIP12755 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIP12755 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIP12755 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms