Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP2C9P11712 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP2C9P11712 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CYP2C9P11712 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms