Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNB1P11230 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNB1P11230 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms