Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLUP10909 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLUP10909 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLUP10909 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLUP10909 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLUP10909 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLUP10909 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLUP10909 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLUP10909 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CLUP10909 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLUP10909 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLUP10909 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLUP10909 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLUP10909 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLUP10909 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms