Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HKR1P10072 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HKR1P10072 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HKR1P10072 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HKR1P10072 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HKR1P10072 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HKR1P10072 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HKR1P10072 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HKR1P10072 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HKR1P10072 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HKR1P10072 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HKR1P10072 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HKR1P10072 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HKR1P10072 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HKR1P10072 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HKR1P10072 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HKR1P10072 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HKR1P10072 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HKR1P10072 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HKR1P10072 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HKR1P10072 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HKR1P10072 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HKR1P10072 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HKR1P10072 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HKR1P10072 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HKR1P10072 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HKR1P10072 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HKR1P10072 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HKR1P10072 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HKR1P10072 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HKR1P10072 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HKR1P10072 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HKR1P10072 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HKR1P10072 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HKR1P10072 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HKR1P10072 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HKR1P10072 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HKR1P10072 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HKR1P10072 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HKR1P10072 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HKR1P10072 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HKR1P10072 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HKR1P10072 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HKR1P10072 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HKR1P10072 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HKR1P10072 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HKR1P10072 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HKR1P10072 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HKR1P10072 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HKR1P10072 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HKR1P10072 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HKR1P10072 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HKR1P10072 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HKR1P10072 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HKR1P10072 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HKR1P10072 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HKR1P10072 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HKR1P10072 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HKR1P10072 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HKR1P10072 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HKR1P10072 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HKR1P10072 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HKR1P10072 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HKR1P10072 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HKR1P10072 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HKR1P10072 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HKR1P10072 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HKR1P10072 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HKR1P10072 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HKR1P10072 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HKR1P10072 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HKR1P10072 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HKR1P10072 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HKR1P10072 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HKR1P10072 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HKR1P10072 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HKR1P10072 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HKR1P10072 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms