Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RGPD1P0DJD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGPD1P0DJD0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD1P0DJD0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD1P0DJD0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD1P0DJD0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD1P0DJD0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms